Znečištění bazénu je faktor, s nímž se musí jeho majitel neustále potýkat a podnikat jak preventivní opatření, tak aktivní kroky k udržení určité úrovně kvality vody v bazénu.

Zdrojem znečištění bazénů jsou jednak samotní koupající se lidé, jednak okolní plochy kolem bazénu, z nichž se do vody zanáší zemina, listí, prach, spad z ovzduší atd.

Základem pro čištění vody od bakterií či sinic je buď levná kartušová nebo dražší, avšak snad po všech stránkách lepší písková filtrace – o tom více v kapitole Příslušenství. Ke správné funkci filtru patří dostatečně časté ruční čištění výměnné vložky filtru (to se nejsnáze provede propláchnutím vložky proudem vody).

Zvláště u „velkých“ nečistot, jako je listí nebo hmyz, může být nejšikovnější ruční čištění, např. s pomocí síťky.

Prevence znečištění bazénu spočívá jednak v osprchování se před vstupem do bazénu (tím lze předejít znečištění prachem, kousky trávy, nebo třeba opalovacím krémem), dále v dohlédnutí na děti, zda bazén neznečišťují nějakou svou vypečenou hrou :-) a v době, kdy bazén nepoužíváme, je samozřejmě ideální jej zajistit krycí plachtou.

Případné zastřešení bazénu pak neochrání bazén jen před mechanickým znečištěním, ale i před nechtěným vznikem vodních řas.

Je dobré občas sledovat míru kyselosti vody (pH) a v případě, že se vymyká doporučenému rozmezí od 7,2 do 7,6, lze ji upravit přípravky pro snížení nebo zvýšení kyselosti vody.

Základní řady chemických přípravků pro údržbu a čištění vody jsou chlorová a peroxidová. Jak je známo, chlor není úplně optimální prvek, neboť na něj mohou mít někteří lidé alergii, a jeho výroba i používání má negativní dopady na životní prostředí. V případě použití chloru by jeho obsah ve vodě neměl překročit 1 mg na litr vody, lze použít i různé stabilizátory nebo neutralizátory chloru. Z již popsaných důvodů je ale mnohem lepší zvolit alternativní způsob úpravy vody. Není ovšem možné „míchat“ přípravky patřící do chlorové a peroxidové řady, takže při změně způsobu úpravy vody asi nezbude, než bazén vypustit, vyčistit a znovu napustit (což je beztak výhodnější tehdy, když je voda v bazénu už delší dobu a je více znečištěná).

Pro movitější majitele bazénů existují zařízení pro ozonizaci (obohacování vody o ozón – O3) nebo „mořskou“ úpravu vody (přeměna vody na slanou – nejde však o pouhé přidání soli do vody, ale o složitější úpravu).

Dále existují rozličné přípravky na úpravu vody – přípravky k hubení řas, vločkovače (zajistí zbytnění nečistot a jejich klesnutí na dno bazénu, odkud je možné je snadno odstranit), rozjasňovače vody i multifunkční přípravky.

V zásadě ale platí, že je lepší mít kvalitní pískovou filtraci vody a používat jen menší množství chemických přípravků, než si z bazénu udělat „chemickou“ lázeň.